Compressione (qualche valvola con scarsa tenuta), portata iniettori non uniforme, albero a camme usurato, sono le cause più probabili; in un motore diesel la differenza di rendimento di un cilindro è molto più evidente a freddo. Qualche informazione in più comunque non farebbe male, avrai fatto qualche indagine, penso.
Ma vibra o gira a tre cilindri? su quesi motori c'era il problema sul cablagio degli iniettori.. fai un a diagnosi e vedi se ti da circuito aperto, se cosi fosse basta intervenire sui connettori..